Sala 1: Al vaivén de las olas del Mar Caribe y el Río Grande de la Magdalena:

Donde en un primer escenario nos embarcaremos a los inicios de aquella ciudad de Bastidas en medio de piratas, fuertes y contrabando, sin antes, aproximarnos al encuentro de las dos culturas – Europeos y Amerindios; luego, en un segundo escenario abordaremos como bogas el proceso de colonización y comercial que vivió el río Grande de la Magdalena, desde sus canoas, champanes, piraguas, hasta llegar a los imponentes barcos de vapor.

Sala 2: Sierra Nevada de Santa Marta, Tierra de Humanos y de dioses:

Un lugar para reconocer ese espacio reflexivo y místico, que se erige con el calificativo de macizo costero más alto del mundo, donde moran actualmente cuatro grupos indígenas y a los cuales el visitante podrá entender y comprender sus principales amenazas hoy en día que van desde la pérdida de su territorio por los procesos de colonización y de religión hasta los cultivos ilícitos.

Sala 3: Santa Marta, Santa Marta tiene…:

Es la oportunidad que tiene el visitante, sin importar su procedencia, de aprender mucho más de la ciudad, aquellos lugares que la identifican, las historia del antiguo Hospital San Juan de Dios, sin olvidarnos de hablar del Ancón, la Marcha del Hambre o de la United Fruit Company alias la “Yunai”; y por supuesto, la religiosidad popular, reconociendo a San Agatón (considerado el único santo parrandero y borrachón), la virgen del Carmen o “la patrona danzante”, poder detenernos en cada uno de los rincones de nuestra Santa Marta, con sus olores, imágenes y sabores. A su vez, visitar las salas de exposiciones temporales donde se reúnen la riqueza histórica y cultural del departamento del Magdalena y de la región del Caribe Colombiano.